密室逃脱13的秘密任务中，隐藏任务主要集中在造王者和水塔两个关键场景。造王者任务围绕国王遇刺事件展开，玩家需扮演乌尔默兄弟，通过修船、降桥、躲避追捕等环节揭露真相。水塔部分则涉及教堂废墟解谜，需移动石球获取木锤，并用凿子破坏喷泉砖块。这些隐藏任务通常需要合成道具或观察环境细节，比如将透镜罩与把手组合成双目镜，或根据显微镜调焦顺序破解颜色密码。
黑暗之城章节的隐藏任务包含火车站和花园广场的线索串联。玩家需在吊车顶部调整公牛标志方向，用远程磁铁获取U型铁，再通过闪光灯与照片显像技术破解相机机关。教堂区域需点燃蜡烛触发石台机关，而配药任务则要求精确调配红、绿、蓝液体单位数。这些任务设计强调逻辑连贯性，例如留声机转盘的安装必须严格遵循翅膀开合顺序，否则无法开启集团宝库场景。
剧场后台的隐藏任务涉及猫头鹰标志碎片收集与机械面罩使用。玩家需用撬锁工具打开雕像底座，将镜框、镜片等部件合成为双目镜，再根据显微镜提示的上上右右右左左调焦规则数清颜色数量。另一处关键是通过留声机播放唱片触发机关，需先拔除唱针并安装高音符曲柄，翻转后调整转盘位置才能激活宝库入口。此类任务常因步骤繁琐而被忽略，但道具交互提示通常藏在对话或场景文字中。
秘密任务的通关技巧在于多角度观察与时间分配。例如世界迷宫任务需拖动钥匙避开刀刃，而能量兑换码等隐藏奖励往往附着于次要道具，如指甲锉或火药分解物。部分任务存在分支选择，如营救兰时需先进入塔楼圆形门，若错误触发卫兵警报则需跳入湖水重置剧情。游戏内报纸、海报数字等细节常作为密码来源，比如4225密码源自鞋柜线索，6724密码则需通过画作照射显现。
隐藏任务的核心机制是环境互动与道具组合。玩家需保持对场景变化的敏感度，例如喷泉盾牌放置后水位下降会露出新通道，而药方与冰块的获取顺序直接影响后续水管拼接。任务难度随进度递增，但所有谜题均遵循观察-推理-验证的逻辑链，未出现超出现实物理规则的解谜方式。
